Ｊ２Ｊ３入れ替え戦でＪ２・２１位の讃岐が残留、Ｊ１昇格プレーオフでＪ２・６位の山形がＪ１昇格を決め、Ｊリーグの昇降格が各カテゴリーで決定した。Ｊ１、Ｊ２、Ｊ３ごとにまとめた。
【Ｊ１からＪ２に降格】
１８位 徳島
１７位 Ｃ大阪
１６位 大宮
徳島は開幕から９連敗と苦戦した。今季は３勝どまりでホームでは勝ち星なしだったが、最終節では優勝したＧ大阪相手に引き分け意地を見せた。
Ｃ大阪はチームが崩壊状態になった。鳴り物入りで獲得したウルグアイ代表ＦＷフォルランが十分に機能せず、反対にチームもフォルランを生かし切れなかった。監督が２度交代するなど、一貫したチーム運営ができなかった。強化にも関わった岡野社長は今季限りで辞任。再建への道のりは険しい。
“落ちない大宮”、“残留力の大宮”と言われた大宮は０５年のＪ１昇格後、１０年間で初めてのＪ２落ちとなった。今季から就任した大熊清監督が８月に解任。今季から就任した強化責任者の鈴木徳彦チーム統括本部長も続いて退任した。監督だけではなく、短期間で強化責任者もチームを去る異例の事態となった。シーズン終了まで指揮を執った渋谷洋樹監督について、鈴木茂社長は続投させる意向を示している。
【Ｊ２からＪ１に昇格】
１位 湘南
２位 松本
６位 山形
湘南は曺貴裁監督が指揮する走り回るサッカーで他クラブを圧倒。年間で勝ち点１０１を獲得した。
松本は元日本代表の故・松田直樹さんの遺志を実現させた。松田さんと親交が深かった田中隼磨がチームを引っ張り、ロングスローとキックが魅力の岩上祐三ら一芸に秀でた選手が力を発揮した。
山形は６位からプレーオフを勝ち抜いての下克上昇格。６月に加入したＧＫ山岸は準決勝は決勝ヘッド、千葉との決勝戦はファインセーブで昇格に大きく貢献した。
【Ｊ２からＪ３に降格】
２２位 富山
開幕から９試合勝ち星なしと出遅れた。１１節から１９節まで９連敗を喫するなど、結果を出せなかった。
【Ｊ３からＪ２に昇格】
１位 金沢
初代のＪ３王者に輝いた。北陸新幹線が来年３月に開通することも追い風か。
