１６日午前１時２５分頃、熊本県で震度６強の地震があった。その後、短時間に震度６弱以上の地震が相次いで３回発生。ビルや家屋が倒壊し、県などによると、新たに男女３２人が死亡、１４日以降の死者は計４１人となった。９万人以上が避難し、九州の広範囲で千人以上が重軽傷を負った。

　熊本県益城町では１４日に最大震度７を観測しているが、気象庁は「今回（午前１時２５分）が１４日以降に発生した地震の本震」との見方を示した。この最初の震度６強の地震はマグニチュード（Ｍ）７・３で、阪神大震災と同じ規模。震源の深さは約１２キロだった。

　１６日未明から続いた地震では大分県内でも家屋が倒壊し、けが人が相次いだ。湯布院や別府では、観光客や住民が避難所などで眠れぬまま朝を迎えた。

　自宅で家具が部屋一面に散らばり、手が付けられない状態になった由布市の江藤孝夫さん（７２）は「四十数年ここに住んでいるが、こんな地震は初めて」と、予期せぬ自然災害に不安そうな表情だ。

　政府は自衛隊や警察などの派遣要員を増強、土砂崩れや倒壊した建物で生き埋めの人もおり、懸命の救出作業を続けた。

　最初の震度６強の後、午前１時４６分ごろ震度６弱、午前３時５５分ごろに震度６強、さらに午前９時４８分ごろ震度６弱があった。気象庁は「最大震度６弱の余震が１週間程度は考えられる」と警戒を呼び掛けた。

　１４日の震度７に始まった一連の地震活動について、専門家は当初の「日奈久（ひなぐ）断層帯」から、北側で隣接する「布田川（ふたがわ）断層帯」に拡大したとみている。大分県の地震は「別府－万年山（はねやま）断層帯」で起きたとみられる。

　九州電力によると、熊本県だけで約４０万戸が停電した。鹿児島県の川内原発と佐賀県の玄海原発に異常はない。ＪＲ九州の在来線は、福岡や宮崎、鹿児島などの区間を除き、始発から運転を見合わせた。熊本空港は発着の全便が欠航した。